Manuel de prélèvement Biologiste

CHLAMYDIA TRACHOMATIS ET/OU DE NEISSERIA GONORRHOEAE (PCR)

Analyse CHLAMYDIA TRACHOMATIS ET/OU DE NEISSERIA GONORRHOEAE (PCR)
Synonymes GENOME : CHLAMYDIA TRACHOMATIS (ADN,ARN) : HYBRID MOLEC AVEC AMPLI GENIQUE, PCR, IST, ISTA, ISTS, ISTG, MYCOPLASMA GENITALIUM, IST (pv, urine), ISTA (anal), ISTS (sperme), ISTG (gorge) = AVEC ORDO ISTSO (pv, urine), ISTSA (anal), ISTSG (gorge) = SANS ORDO, MPG, MPL
Principales indications Le terme Infection Sexuellement Transmissible (IST) est utilisé pour faire référence à un ensemble de syndromes cliniques variables causés par des pathogènes pouvant être acquis ou transmis lors d'activités sexuelles.
Plus de 30 bactéries, virus, et parasites pathogènes sont sexuellement transmissibles et forment un groupe infectieux nommé Infections Sexuellement Transmissibles (IST). Certaines IST peuvent augmenter le risque d'acquisition du VIH par un facteur de 3 ou plus.
Les IST peuvent avoir des conséquences sérieuses au delà de l'impact immédiat de l'infection, via la transmission de la mère à l'enfant d'infections et de maladies chroniques.
Plus d'un million de personnes par jour sont contaminés par une IST. Chaque année, environ 500 million de personnes contractent l'une des 4 IST suivantes: chlamydia, gonorrhée, syphilis ou trichomononase.
Spécialité biologie moléculaire
Technique de dosage PCR multiplex
Examen sous-traité Non
code SIL

IST (pv, urine), ISTA (anal), ISTS (sperme), ISTG (gorge) = AVEC ORDO ISTSO (pv, urine), ISTSA (anal), ISTSG (gorge) = SANS ORDO MPG, MPL

Examen remboursé Oui
Tarif Non
Conditions tarifaires
Paramètre toujours urgent Non
Préparation du patient volume des urines 1er jet suffisant pour remplir un tube bouchon beige (tube chimie urinaire sans additif)
Jeun Non
Rythme circadien Non
Renseignements cliniques à fournir et instructions complémentaires examen à effectuer en dehors de la période des règles.
Examen nécessitant une fiche de renseignement indispensable Non
Type de prélèvement urines, écouvillonnage localisé (femme), sperme
Instructions de prélévement Femme: Ecouvillon avec milieu de transport (type ESwab) par prélèvement vaginal (ou autoprélèvement) ou recueil d'un premier jet d'urine à distance (> 2 heures) de la miction précédente Homme: Recueil d'un premier jet d'urine à distance (> 2 heures) de la miction précédente (en cas d'urétrite symptomatique, privilégier le prélèvement de l'écoulement (et non un 1er jet) afin d'optimiser l'éventuel antibiogramme.)
Visualiser les instructions de prélèvement
Contenant Tube sans conserv. chimie urinaire beige
Contenant acceptable Écouvillon e-swab rose
Quantité minimale sperme: 1 mL Urines 1er jet: transférer dans un tube beige (tube chimie urinaire sans conservateur) urines natives: 10-30 mL
Mettre à l'abri de la lumière Non
Délai maximum entre prélèvement et arrivée au laboratoire 2h
Prélèvement au laboratoire indispensable Non
Température de transport au laboratoire Temperature ambiante
Critères d' acceptation préanalytique - Conservation sans milieu de transport: 2h à T°ambiante
* urines 1er jet (transférées sur tube beige) 1 semaine à 4°C
* sperme 1 semaine à 4°C
- Conservation avec milieu de transport (ESwab)
* écouvillonnage génital: 5 jours à T°ambiante, 1 semaine à 4°C
* prélèvements oro-pharyngés (gorge): 3 jours à 4°C
* prélèvements ano-rectaux: 2 jours à 4°C
Transport vers site unité technique
Délai maximum de reprise de l'échantillon 5 jours
Délai de stockage et conservation des échantillons après analyse (vérification ID) 5 jours entre 2 et 8°C
Fréquence de réalisation 5/s
Délai prévisionnel de rendu 3 jours
Résultat pouvant être communiqué par secrétaire Non
Examens complémentaires pouvant être générés selon le résultat Oui
Détail des examens complémentaires En cas de PCR Mycoplasma genitalium positive, une PCR MG & AziR Assay pour la détection des mutations de A2058G, A2058C, A2058T, A2059G, A2059C et A2059T dans le gène 23S rRNA responsable de la résistance à l'azithromycine de Mycoplasma genitalium sera lancée
Plateau technique exécutant Externe / Non définie
Instructions techniques conférence du Sabine Pereyre du CNR IST bactériennes au Journées pour l'avenir de la biologie médicale
biblio IST dans basedoc/analytique/microbiologie-mycologie-pcr/bibliographie microbio
Interférences
Code tube regroupement PAD
Alerte pré-analytique PAD
Type de prélèvement PAD BACT
Nombre de tube(s) PAD 1
Versions fiche CHLAMYDIA TRACHOMATIS ET/OU DE NEISSERIA GONORRHOEAE (PCR)
Version Date Action Reviseur Commentaires
Fiche mise à jour le 02/07/2025

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