| Analyse | MICROBIOLOGIE (IST) | |||
| Synonymes | VAGINOSE VAGINITE MYCOSE ATOPOBIUM VAGIANE GARDNERELLA MICROBIOLOGIE trichomonas vaginalis (PRELEVEMENT VAGINAL) Mobiluncus Gardnerella Lactobacillus spp score de Nugent Chlamydiae Trachomatis Neisseria. Gonorrhoeae Mycoplasma.genitalium Ur. parvum Uréaplama .urealyticum Mycoplasme hominis GENOME : CHLAMYDIA TRACHOMATIS (ADN,ARN) : HYBRID MOLEC AVEC AMPLI GENIQUE, PCR, IST, ISTA, ISTS, ISTG, MYCOPLASMA GENITALIUM, IST (pv, urine), ISTA (anal), ISTS (sperme), ISTG (gorge) = AVEC ORDO ISTSO (pv, urine), ISTSA (anal), ISTSG (gorge) = SANS ORDO, MPG, MPL | |||
| Principales indications | 1. Leucorrhées anormales (abondantes, malodorantes, colorées) : Recherche d'infection (vaginose, mycose, IST...) 2. Douleurs pelviennes ou prurit vulvaire : Orientation vers une infection génitale basse ou haute (endométrite, salpingite) 3. Suspicion d’infection sexuellement transmissible (IST) : Recherche de Chlamydia, Gonocoque, Trichomonas, Mycoplasmes (par PCR ou culture) 4. Bilan d’infertilité ou fausses couches à répétition : Recherche d’infections chroniques ou silencieuses (ex : Chlamydia) 5. Surveillance de grossesse à risque infectieux : Dépistage de streptocoque B au 3e trimestre, ou infection ascendante (si menace d’accouchement prématuré) 6. Suivi post-traitement d'une infection vaginale : Vérifier la disparition de l’agent pathogène |
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| Spécialité | Microbiologie | |||
| Technique de dosage | ED + culture +/ ID +/ antibiogramme | |||
| Examen sous-traité | Non | |||
| code SIL |
PVPCR IST = IST (pv, urine), ISTA (anal), ISTS (sperme), ISTG (gorge) = AVEC ORDO ISTSO (pv, urine), ISTSA (anal), ISTSG (gorge) = SANS ORDO MPG, MPL, PU SUIVIGRO8M |
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| Examen remboursé | Oui | |||
| Tarif | Non | |||
| Conditions tarifaires | ||||
| Paramètre toujours urgent | Non | |||
| Préparation du patient | Eviter toute toilette intime, tout traitement local (crème, gels, savons). Éviter le prélèvement pendant la période menstruelle, car la flore est modifiée (sauf avis contraire du prescripteur). À réaliser avant ou à distance de tout traitement antibiotique (> 5 jours pour les germes banaux) sauf décision explicite du médecin. Une recherche de Chlamydia/gonocoque par PCR est effectuée (sauf virginité). | |||
| Jeun | Non | |||
| Rythme circadien | Non | |||
| Renseignements cliniques à fournir et instructions complémentaires | Feuille de renseignements complète obligatoire. Femme est enceinte : préciser s'il s'agit d'une grossesse à risque (cerclage, RPM, MAP, fissure poche des eaux, etc) pour recherches spécifiques | |||
| Examen nécessitant une fiche de renseignement indispensable | Oui | |||
| Télécharger la fiche de renseignement | ||||
| Type de prélèvement | Prélèvement gynécologique | |||
| Instructions de prélévement | Femmes = recommandé : Ecouvillonnage des sécrétions vaginales avec milieu de transport (Amies). Voir préconisations à fournir pour les auto-prélèvements (Introduire doucement l’écouvillon dans le vagin sur une distance d’environ 3 cm, à défaut : 1er jet urinaire à distance (> 2 heures) de la miction précédente, moins sensible+++) Hommes = 1er jet urinaire à distance (> 2 heures) de la miction précédente (en cas d'urétrite symptomatique, privilégier le prélèvement de l'écoulement (et non un 1er jet) afin d'optimiser l'éventuel antibiogramme.) Pour les prélèvements anaux : Insérer délicatement l’écouvillon dans le rectum à environ 3 à 5 cm de profondeur et faire doucement tourner l’écouvillon pendant 5 à 10 secondes. Pour les prélèvements pharyngés : Insérer délicatement l’écouvillon dans la bouche, en veillant à maintenir en contact avec les amygdales et le fond de la gorge, puis retirer l’écouvillon sans toucher l’intérieur des joues, ni de la langue. | |||
| Visualiser les instructions de prélèvement | ||||
| Contenant | Écouvillon e-swab rose | |||
| Contenant acceptable | Écouvillon transwab orange | |||
| Quantité minimale | - Sperme: 1 mL - Urines 1er jet : transférer dans un tube beige (tube chimie urinaire sans conservateur) - Ecouvillons ESWAB pour les prélèvements génitaux (FEMME) - écouvillons ESWAB pour prélèvement ORAL ANAL | |||
| Mettre à l'abri de la lumière | Non | |||
| Délai maximum entre prélèvement et arrivée au laboratoire | 48h | |||
| Prélèvement au laboratoire indispensable | Non | |||
| Température de transport au laboratoire | Température ambiante | |||
| Critères d' acceptation préanalytique | - Conservation sans milieu de transport : 2 heures à T° ambiante * urines 1er jet (transférées sur tube beige) : 1 semaine réfrigéré * sperme 1 semaine réfrigéré - Conservation avec milieu de transport (ESwab) * écouvillonnage génital : 5 jours à T° ambiante, 1 semaine réfrigéré * prélèvements oro-pharyngés (gorge) : 3 jours réfrigéré * prélèvements ano-rectaux : 2 jours réfrigéré |
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| Transport vers site unité technique | Température ambiante | |||
| Délai maximum de reprise de l'échantillon | ||||
| Délai de stockage et conservation des échantillons après analyse (vérification ID) | 5 jours entre 2 et 8°C | |||
| Fréquence de réalisation | Lundi au Vendredi | |||
| Délai prévisionnel de rendu | 3 jours | |||
| Résultat pouvant être communiqué par secrétaire | Non | |||
| Examens complémentaires pouvant être générés selon le résultat | Oui | |||
| Détail des examens complémentaires | En cas de PCR Mycoplasma genitalium positive, une PCR MG & AziR Assay pour la détection des mutations de A2058G, A2058C, A2058T, A2059G, A2059C et A2059T dans le gène 23S rRNA responsable de la résistance à l'azithromycine de Mycoplasma genitalium sera lancée | |||
| Plateau technique exécutant | Bactério-Virologie-Parasito-Mycologie (S.Clotilde) | |||
| Instructions techniques | ||||
| Interférences | conférence du Sabine Pereyre du CNR IST bactériennes au Journées pour l'avenir de la biologie médicale biblio IST dans basedoc/analytique/microbiologie-mycologie-pcr/bibliographie microbio |
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| Code tube regroupement PAD | A | |||
| Alerte pré-analytique PAD | ! FICHE DE RENSEIGNEMENT CLINIQUE A REMPLIR ! | |||
| Type de prélèvement PAD | BACT | |||
| Nombre de tube(s) PAD | 1 | |||
| Versions fiche MICROBIOLOGIE (IST) | ||||
| Version | Date | Action | Reviseur | Commentaires |
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| Fiche mise à jour le 14/08/2024 |