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RECHERCHE DIRECTE de Chlamydia trachomatis et/ou de Neisseria gonorrhoeae par amplification génique

Analyse RECHERCHE DIRECTE de Chlamydia trachomatis et/ou de Neisseria gonorrhoeae par amplification génique
Synonymes GENOME : CHLAMYDIA TRACHOMATIS (ADN,ARN) : HYBRID MOLEC AVEC AMPLI GENIQUE, PCR, IST, ISTA, ISTS, ISTG, MYCOPLASMA GENITALIUM
Spécialité biologie moléculaire
Technique de dosage PCR multiplex
Détail de la technique de dosage Le test AllplexTM STI Essential est un test qualitatif in vitro pour la détection de Chlamydia trachomatis (CT), Neisseria gonorrhoeae (NG), Mycoplasma genitalium (MG), Mycoplasma hominis (MH), Ureaplasma urealyticum (UU), Ureaplasma parvum (UP), et Trichomonas vaginalis (TV) dans l'urine, les génital swab, le sperme. La recherche est possible également sur les prelèvements anal et gorge.
ATTENTION: Seul Mycoplasma genitalium est pris en charge pour les patients symptomatiques ou en suivi de traitement. Les autres mycoplasmes (code SIL: MPL) sont HN.
Nature de l'échantillon Ecouvillonnage vaginal, urines 1er jet, sperme, anal ou gorge
Principales indications Le terme Infection Sexuellement Transmissible (IST) est utilisé pour faire référence à un ensemble de syndromes cliniques variables causés par des pathogènes pouvant être acquis ou transmis lors d'activités sexuelles.
Plus de 30 bactéries, virus, et parasites pathogènes sont sexuellement transmissibles et forment un groupe infectieux nommé Infections Sexuellement Transmissibles (IST). Certaines IST peuvent augmenter le risque d'acquisition du VIH par un facteur de 3 ou plus.
Les IST peuvent avoir des conséquences sérieuses au delà de l'impact immédiat de l'infection, via la transmission de la mère à l'enfant d'infections et de maladies chroniques.
Plus d'un million de personnes par jour sont contaminés par une IST. Chaque année, environ 500 million de personnes contractent l'une des 4 IST suivantes: chlamydia, gonorrhée, syphilis ou trichomononase.
Biologiste responsable
Manuel de prélévement Réunilab
Analyse vétérinaire Non
Laboratoires exécutants
Exécutant Pour les sites
REUNILAB STE CLOTILDE (PT W) Sites Nord, Sud, Est, Ouest,
Examen accrédité Cofrac
Commentaires COFRAC
Famille COFRAC Microbiologie – Bactériologie (BACTH)
Référence dossier validation des méthodes
Lien référence dossier validation des méthodes
Renseignements secrétariat
code BIOMNIS
code SIL

IST, ISTA, ISTS, ISTG, MPG, MPL
commentaire SIL ATTENTION: Seul Mycoplasma genitalium est pris en charge pour les patients symptomatiques ou en suivi de traitement. Les autres mycoplasmes (code SIL: MPL) sont HN.
Code LOINC
Délai de rendu
(hors délai de la poste)		 3 jours
Fréquence de réalisation 5/s
Code NABM 5301
Exigences NABM La recherche de Chlamydia trachomatis et/ou de Neisseria gonorrhoeae s’inscrit principalement dans le cadre :
du diagnostic étiologique et du suivi d’efficacité thérapeutique d’une infection génitale symptomatique, haute ou basse ou
d’une rectite ;
du diagnostic étiologique et du suivi d’efficacité thérapeutique d’une pneumopathie néonatale à Chlamydia trachomatis ou
d’une conjonctivite ;
du dépistage des infections génitales asymptomatiques dans des circonstances particulières : dépistage des personnes à risque, bilan d’hypofertilité ;
du diagnostic étiologique et du suivi d’efficacité thérapeutique des arthrites réactionnelles.
Un seul site est à analyser sauf dans les cas suivants : selon le comportement sexuel :
en cas de rapport sexuel anal et/ou pharyngé : rechercher C. trachomatis et N. gonorrhoeae dans les deux ou trois sites : association prélèvements génital, rectal, et/ou pharyngé ;
si la symptomatologie clinique fait évoquer une arthrite réactionnelle, rechercher C. trachomatis dans deux ou trois sites : génital, conjonctival, articulaire ;
dans l’exploration d’une infection haute, rechercher les deux bactéries au niveau du col, et/ou du haut appareil génital
(endomètre, liquide de Douglas, biopsie des trompes, par exemple) : un ou deux sites ;
dans l’exploration d’une épididymite d’une prostatite, d’une infertilité d’origine masculine : rechercher les bactéries dans le
premier jet d’urine et dans le sperme ;
dans l’exploration de la lymphogranulomatose vénérienne (LGV), rechercher C. trachomatis dans le ganglion satellite et les éventuelles ulcérations.
Une seule cotation 5301 par patient.
Prix fixe Oui
Conditions tarifaires changement de cotation applicable à partir du 30/06/2018
ATTENTION: Seul Mycoplasma genitalium est pris en charge pour les patients symptomatiques ou en suivi de traitement. Les autres mycoplasmes (code SIL: MPL) sont HN.
Paramètre potentiellement prescrit dans le cadre de l'urgence Non
Paramètre toujours urgent Non
Analyse apparaissant sur le compte rendu patient Non
Entente préalable Non
Attestation de consultation - Consentement Non
Documents à compléter
Cotation
Examen non remboursé (HN) Non
Prix € 0
Conditions HN ATTENTION: Seul Mycoplasma genitalium est pris en charge pour les patients symptomatiques ou en suivi de traitement. Les autres mycoplasmes (code SIL: MPL) sont HN.
Préconisations Pré-analytiques
Examen complémentaire selon résultat Oui
Détail de l'examen complémentaire En cas de PCR Mycoplasma genitalium positive, une PCR MG & AziR Assay pour la détection des mutations de
A2058G, A2058C, A2058T, A2059G, A2059C et A2059T dans le gène 23S rRNA responsable de
la résistance à l'azithromycine de Mycoplasma genitalium sera lancée
Préparation du patient volume des urines 1er jet suffisant pour remplir un tube bouchon beige (tube chimie urinaire sans additif)
Jeun Non
Renseignements cliniques à fournir et instructions complémentaires examen à effectuer en dehors de la période des règles.
Type de prélévement urines, écouvillonnage localisé (femme), sperme
Instructions de prélévement Femme: Ecouvillon avec milieu de transport (type ESwab) par prélèvement vaginal (ou autoprélèvement) ou recueil d'un premier jet d'urine à distance (> 2 heures) de la miction précédente
Homme: Recueil d'un premier jet d'urine à distance (> 2 heures) de la miction précédente
(en cas d'urétrite symptomatique, privilégier le prélèvement de l'écoulement (et non un 1er jet) afin d'optimiser l'éventuel antibiogramme.)
Instructions de prélévement
Rythme Circadien Non
Bon de demande Non
Notice d'envoi Non
Fiche à télécharger Non
Matériel de prelevement Sachet de transport pour microbiologie
Contenant Tube sans conserv. chimie urinaire beige
Contenant acceptable Écouvillon e-swab rose
Contenant acceptable autre Flacon urine jaune 60 ml
Autres contenants
    Tube gel avec séparateur autorisé Non
    Quantité minimale sperme: 1 mL
    Urines 1er jet: transférer dans un tube beige (tube chimie urinaire sans conservateur)
    urines natives: 10-30 mL
    Mettre à l'abri de la lumière Non
    Critères d' acceptation préanalytique - Conservation sans milieu de transport: 2h à T°ambiante
    * urines 1er jet (transférées sur tube beige) 1 semaine à 4°C
    * sperme 1 semaine à 4°C
    - Conservation avec milieu de transport (ESwab)
    * écouvillonnage génital: 5 jours à T°ambiante, 1 semaine à 4°C
    * prélèvements oro-pharyngés (gorge): 3 jours à 4°C
    * prélèvements ano-rectaux: 2 jours à 4°C
    Liens critères d' acceptation préanalytique
    Prélèvement au laboratoire indispensable Non
    Délai maximum entre prélèvement et arrivée au laboratoire 2h
    Liens délai maximum entre prélèvement et arrivée au laboratoire
    Température de transport au laboratoire Température ambiante
    Lien température de transport au laboratoire
    Température de transport site unité technique Température refrigérée
    Délai de conservation de l'analyte sur échantillon adéquat conservé au laboratoire 5 j entre 2 et 8°C
    Délai de stockage et conservation des échantillons après analyse (vérification ID) 2 jours entre 2 et 8°C
    Jour de prélèvement souhaitable pas d'impératif
    Préconisations analytiques
    Fréquence de réalisation 5/s
    Délai technique j3
    Délai maximum j5
    interférences analytiques / hémolyse Non
    Détails interférences hemolyse
    interférences analytiques / bilirubine Non
    Détails interférences bilirubine
    interférences analytiques / lipémie Non
    Détails interférences lipémie
    interférences autre Non
    Détail interférences autre
    Interférences analytiques liens
    Fiche technique
    Fiche technique liens
    FDS réactif
    FDS réactif liens
    Unité technique
    Référence document qualité Biblio conditions et délais conservation/transport:
    Remic 2022 - chap 125 p 1100
    Fiche technique écouvillons ESwab® Copan
    Fiche technique AllplexTM STI Essential Assay
    Lien référence document qualité
    Préconisations post-analytiques
    Valeurs usuelles ou thérapeutiques
    Existence de valeurs critiques Non
    Valeurs critiques
    Valeurs critiques liens
    Incertitude de mesure, spécificité-sensibilité Voir E1EN01
    Prestation de conseils conférence du Sabine Pereyre du CNR IST bactériennes au Journées pour l'avenir de la biologie médicale biblio IST dans basedoc/analytique/microbiologie-mycologie-pcr/bibliographie microbio
    Liens prestation de conseils
    Incidence grossesse sur interprétation Non
    Documents BIOMMIS
    Documents CERBA
    Bibliographie RéuniLAB
    Biothèque 1 an -20°C Non
    Maladie à déclaration obligatoire MDO Non
    liens MDO
    Versions fiche RECHERCHE DIRECTE de Chlamydia trachomatis et/ou de Neisseria gonorrhoeae par amplification génique
    Version Date Action Reviseur Commentaires
    Fiche mise à jour le 28/11/2024

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